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技術服務 抗體測序服務

更新時間:2020-05-14點擊次數:2024

艾柏森生物科技有限公司作為值得信賴的抗體研發服務供應商,擁有專業的技術團隊,可為客戶提供的抗體測序服務。艾柏森生物打造的全新一代抗體測序平臺,基于蔦槍法與抗體數據庫相結合的技術“Database Assisted Shotgun Sequencing”(DASS)技術,這項技術還適用于其他亞型和不同形式的抗體,如:IGM,熒光偶聯抗體,固定化抗體,不同物種的抗體等。

 

等重氨基酸測序

與其它基于MS測序方法不同的是,我們可以分辨大多數等重氨基酸復合物

★ W可與GE、AD、SV區分

★ R可從GV中區別出來

★ Q可從GA、K中區別出來

★ N可從GG中區別出來

 

Database Assisted Shotgun Sequencing, DASS

Figure 1.Workflow of Service

 

運用DASS技術對V、J、C片段測序

 

  目前已有的一些數據庫(如NCBI)雖包含抗體V、J、C片段序列,但是在抗體成熟的過程中,一個B細胞中的抗體基因要經過體細胞突變的過程才會產生高親和力的成熟抗體。

  我們采用*的計算方法,并能匹配相應物種的突變肽段,保證每條肽段都會被檢測到,且每一個氨基酸位點都會生成20-7-條MS/MS光譜,對難測序的proline和arginine的肽段也可實現測序。

 

Database Assisted Shotgun Sequencing, DASS

Figure 2.Sequence coverage is verified with the integrity of the combination of multipleLC-MS/MS datasets

 

CDR3區測序

  抗體輕鏈的CDR3去多由胚系基因編碼,而重鏈的CDR3區則由D基因編碼,D基因大部分區域由于受到核酸酶及末端轉移酶等重組酶的作用而發生基因重排,導致抗體重鏈CDR區在數據庫中無法進行同源對比,而只能對其進行de novo測序。高質量的質譜數據與高效率的數據挖掘算法的結合,使我們對抗體CDR3區域的解讀更為有力,我們可以測得數據庫中無同源序列的20kDa的蛋白質。

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